1938 год 2 июля
по решению Военного совета Тихоокеанского флота в бухте Тарья на о-ве Лахтажный начато создания пункта базирования подводных лодок.

1938 год 15 августа
На Камчатку на постоянное базирование прибыли первые подводные лодки типа «Л» XI серии: «Л-7» (командир кап. 3 ранга Царульников Н.И.), «Л-9» (командир кап.-лейтенант Никифоров М.К.), «Л-10» (командир кап. 3 ранга Павлов Ф.Ф.) и плавбаза «Саратов». Все прибывшие лодки и плавбаза были включены в состав вновь сформированного 41-го отдельного дивизиона 4-й бригады подводных лодок Тихоокеанского флота. Первый командир дивизиона – кап. 3 ранга Кулагин А.Ф. Первоначально дивизион находился в акватории судоремонтного завода в бухте Раковая, недалеко от Петропавловска-Камчатского.

1939 год июнь
в состав дивизиона прибыли новые подводные лодки: «Л-8» и «Л-11». В этом же месяце командиром дивизиона был назначен кап. 2 ранга Кисилёв В.
Всего в период с июня 1939 года по август 1941 года из Владивостока на постоянное базирование прибыли следующие подводные лодки: «Л-12», «Л-14», «Л-15» и «Л-16». Одновременно на о-ве Лахтажном продолжалось строительство места базирования подводных лодок.

1939 год 5 ноября
приказом командующего Тихоокеанским флотом объявлено об окончании формирования 41-го отдельного дивизиона подводных лодок.

1942 год сентябрь
Государственный Комитет Обороны СССР принял решение о передаче кораблей из состава Тихоокеанского флота в состав Северного флота: четырех пл типа «С» IX-бис серии из Владивостока и двух подводных лодок типа «Л» с Камчатки. Общее командование переходом было возложено на Героя Советского Союза кап. 1 ранга Трипольского А.В. По плану первыми должны были выходить подводные лодки «Л-15» (командир кап.-л-т Комаров В.И.) и «Л-16» (командир кап.-л-т Гусаров Д.Ф.). Старшим в группе назначен командир «Л-16». 25 сентября из Авачинской бухты лодки вышли в море, и 1 сентября прибыли в порт Датч-Харбор. По требованию американской стороны переход до Сан-Франциско должен был осуществляться только в надводном положении.

1942 год 11 октября
примерно в 800-х милях от берега «Л-16» была внезапно атакована неизвестной подводной лодкой. Торпеда попала в среднюю часть лодки, после чего она почти сразу же затонула, погиб весь экипаж из 55 человек. С борта «Л-15» успели сделать несколько выстрелов по показавшейся рубке атаковавшей субмарины. Экипаж Комарова В.И. в одиночку через Панамский канал и северную Атлантику дошёл до порта Галифакс, где дождался подхода остальных четырёх подводных лодок. Вместе они пересекли Атлантический океан и в марте 1943 года прибыли в Полярный.

1942 год с октября по июль 1943 года
из Владивостока в состав 3-го отдельного дивизиона, которым командует кап. 2 ранга Павлов Ф.Ф., прибывают подводные лодки типа «Щ» V серии и V-бис серии: «Щ-105», «Щ-106» и «Щ-114».

1945 год май
сформирован 3-й отдельный дивизион подводных лодок Тихоокеанского флота

1945 год август
с началом боевых действий против императорской Японии, дивизион принял участие в десантной операции по освобождению о-ва Шумшу (Симусю). Подводная лодка «Л-8» (командир кап. 3 ранга Судейко В.) осуществила оперативное прикрытие десантной операции, поиск японских кораблей при выходе из военно-морской базы Катаоко (о-в Шумшу). Плавбаза «Саратов» перевозила войска и грузы, эвакуировала раненных из района боевых действий. Подводная лодка «Щ-105» ставила минные заграждения на подходах к Авачинской бухте. Десантный батальон, сформированный в основном из личного состава плавбаз «Саратов» и «Север», участвовал в штурме и освобождении о-ва Шумшу.

1945 год 18 августа
произведена высадка десанта на о-ве Шумшу. При штурме высоты № 171 ст. 1-й статьи Вилков Н.А., боцман плавбазы «Саратов», повторил подвиг Александра Матросова, закрыв своим телом амбразуру японского дота.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 14 сентября 1945 года старшине 1-й статьи Вилкову Николаю Александровичу присвоено звание Герой Советского Союза (посмертно).
Всего в проведении десантной операции на о-ве Шумшу участвовало 158 подводников и моряков береговой базы, из них погибло 27 человек, 39 было ранено.
Дозор и прикрытие десанта осуществлял экипаж подводной лодки «Л-6». Задачи по блокированию коммуникаций противника выполняли экипажи подводных лодок «Л-10», «Щ-105» и «Щ-106». Разведку сил противника было поручено вести экипажу подводной лодки «Л-13».

1945 год сентябрь
на базе 3-го отдельного дивизиона сформирована 5-я бригада подводных лодок. Первый командир – кап. 2 ранга Курносов И.И., командир береговой базы – кап. 3 ранга Цветков И.

1945 год 1 декабря
5-я бригада подводных лодок перешла в подчинение вновь сформированной Камчатской военной флотилии. Командующий КВФ – вице-адм. Виноградов Н.В.

1946 год 20 июня
подводная лодка «Щ-111» под командованием капитана Голованова А. выполнила задачи по обеспечению работ гидрографической экспедиции Тихоокеанского флота в районе Курильских островов.

1947 год
по решению командования ВМФ СССР было создано первое ремонтное подразделение, впоследствии ставшее плавучим судоремонтным заводом.

1947 год 16 июля
в состав 5-й бригады вошла плавбаза «Теодор Нетте».

1949 год
5-я бригада заняла 1-е место на Тихоокеанском флоте по торпедной стрельбе.

1950 год
успешно завершен межфлотский переход по Северному пути на Камчатку двух подводных лодок – «С-25», «С-26» (типа «С» IX-бис серии).
На Камчатку также прибывают подводные лодки из Порт-Артура из состава 4-й бригады подводных лодок.

1951 год апрель
на базе 5-й бригады подводных лодок сформирована 16-я дивизия подводных лодок. Первый командир – контр-адм. Савич-Демянюк В.И., начальник штаба – кап. 1 ранга Резников А. В составе дивизии сформированы 91-я и 92-я бригады подводных лодок.

1951 год с 17 по 26 ноября
подводные лодки «Б-10» и «Б-12» типа «Л» совершили штурманский переход по маршруту: Петропавловск-Камчатский – мыс Африка – мыс Столбовый – Петропавловск-Камчатский. Пройдено 1108 миль, решено более 200 астрономических задач.

1952 год 1 мая
вышел первый номер дивизионной газеты «Во славу Родины» (ныне – «Залп»). Первым редактором газеты стал кап. л-т Кременчугский И.

1952 год с 6 по 18 ноября
плавбаза «Саратов» по приказанию командующего КВФ выполняла задачи по ликвидации последствий стихийного бедствия – цунами, обрушившегося на Северо-Курильск. Моряки приняли участие в эвакуации на Камчатку жителей пострадавшего от стихии островного рыбачьего поселка.